More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2085 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2085  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0478612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3080  mechanosensitive ion channel family protein  96.97 
 
 
297 aa  531  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000145775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2243  mechanosensitive ion channel family protein  95.29 
 
 
297 aa  524  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0942779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2288  mechanosensitive ion channel family protein  95.62 
 
 
297 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.07151e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2291  mechanosensitive ion channel family protein  94.61 
 
 
297 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2107  mechanosensitive ion channel family protein  95.29 
 
 
297 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.158138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2046  mechanosensitive ion channel family protein  95.29 
 
 
297 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2044  mechanosensitive ion channel family protein  95.29 
 
 
297 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2263  mechanosensitive ion channel family protein  95.29 
 
 
297 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.615589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2373  mechanosensitive ion channel family protein  94.28 
 
 
297 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.154175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 
303 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 
283 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 
278 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  41.21 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  31.25 
 
 
286 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 
282 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 
370 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  27.96 
 
 
291 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 
299 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  31.25 
 
 
286 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 
282 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
260 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
335 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 
773 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 
288 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 
283 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 
550 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 
582 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 
394 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 
356 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 
693 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  27.78 
 
 
537 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 
821 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 
784 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
718 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
716 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
837 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 
266 aa  92.4  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 
838 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 
822 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 
876 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 
538 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 
600 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
528 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 
822 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
528 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 
822 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
716 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  24.18 
 
 
767 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  24.55 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  22.81 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  23.16 
 
 
879 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  28.1 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 
658 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  25.58 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  28.1 
 
 
293 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  32.93 
 
 
263 aa  89  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 
293 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 
293 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 
293 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 
293 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 
293 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 
871 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 
697 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  23.2 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  28.37 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  23.29 
 
 
771 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 
705 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 
864 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 
762 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 
787 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
325 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  27.27 
 
 
656 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 
719 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 
569 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 
569 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  25.38 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 
650 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  29.56 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
652 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  29.56 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  37.19 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 
718 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>