95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1366 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  98.97 
 
 		 322 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  98.97 
 
 		 315 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  98.97 
 
 		 315 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1561  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1366  transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0476  LysR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 233 aa  143  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 300 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 299 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 299 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 299 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 306 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 302 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  63.51 
 
 		 299 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  60.81 
 
 		 299 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  55.84 
 
 		 298 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  59.74 
 
 		 298 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  53.25 
 
 		 298 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  55.13 
 
 		 300 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 299 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 301 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  60 
 
 		 304 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  63.51 
 
 		 296 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  51.25 
 
 		 298 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 294 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 295 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 325 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 291 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  37.68 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01360  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 296 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 313 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 300 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  36.62 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 313 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 322 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  34.29 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 294 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 294 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5088  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 317 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.375083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 303 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 313 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 311 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1552  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 287 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0365883  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4789  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 317 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 305 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4703  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 317 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0971  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0661405  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 293 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 293 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 313 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 308 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 301 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 305 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 313 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 297 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 297 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 304 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>