49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0476 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0476  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  87.91 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  87.91 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  87.91 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1561  LysR family transcriptional regulator  87.91 
 
 		 97 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1366  transcriptional regulator  87.91 
 
 		 97 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 300 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 328 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 300 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 299 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 302 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  53.62 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  55.07 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  54.93 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  47.89 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  57.75 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  56.52 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  45.07 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  50 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 313 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01360  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0364  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 303 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 303 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 295 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>