More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26820  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  884    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  72.34 
 
 
442 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0037  major facilitator family transporter  74.03 
 
 
448 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.729938  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0043  major facilitator family transporter  74.43 
 
 
448 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.768707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  41.03 
 
 
461 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 
435 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.05 
 
 
430 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.38 
 
 
437 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.92 
 
 
437 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  35.54 
 
 
439 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  35.83 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.13 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  35.83 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  35.83 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  34.98 
 
 
439 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  35.25 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  35.36 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.89 
 
 
452 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
452 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  35.29 
 
 
439 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
440 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  37.08 
 
 
445 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  37.37 
 
 
442 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.53 
 
 
450 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  35.05 
 
 
439 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  34.8 
 
 
439 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  35.05 
 
 
439 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  35.05 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  36.52 
 
 
439 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.17 
 
 
444 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.7 
 
 
455 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
435 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  36.36 
 
 
441 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.78 
 
 
433 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
458 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.75 
 
 
468 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.34 
 
 
439 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  35.12 
 
 
456 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
437 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  37.31 
 
 
430 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
431 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  35.94 
 
 
457 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  36.8 
 
 
442 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  36.21 
 
 
458 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  35.1 
 
 
455 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  36.66 
 
 
430 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  36.21 
 
 
457 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.21 
 
 
457 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  36.21 
 
 
457 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.22 
 
 
446 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.79 
 
 
437 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  33.92 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  36.43 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.75 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.2 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  37.03 
 
 
445 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
453 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
444 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36.17 
 
 
442 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  37.65 
 
 
445 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  36.25 
 
 
435 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  34.67 
 
 
482 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.7 
 
 
459 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.98 
 
 
450 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  36.71 
 
 
460 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  35.99 
 
 
441 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  36.57 
 
 
450 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  35.05 
 
 
465 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  36.32 
 
 
460 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  36.32 
 
 
460 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  37.47 
 
 
438 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  40.61 
 
 
452 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
438 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
472 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  36.32 
 
 
445 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  34.92 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  34.92 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  36.08 
 
 
445 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  36.08 
 
 
445 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  33.87 
 
 
461 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  33.87 
 
 
461 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  33.87 
 
 
461 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.24 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  36.77 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.55 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  33.18 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  34.05 
 
 
438 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.34 
 
 
434 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  34.05 
 
 
438 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  35 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  34.05 
 
 
438 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  35 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  34.05 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.05 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  34.05 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  34.32 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  34.76 
 
 
435 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>