More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0540 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0540  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 379 aa  780    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0240139  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.71 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  37.14 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.29 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.15 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.03 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.03 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 		 436 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 436 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  38.61 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 430 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.42 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  37.11 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  35.54 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  37.93 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  32.41 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  38.03 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 		 438 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  41.86 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.93 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 433 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.74 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  33.97 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  39.13 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.59 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  34.28 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  37.66 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  33.97 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  33.97 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  35.11 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  37.18 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  34.31 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  34.32 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  34.37 
 
 		 456 aa  175  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 417 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 437 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>