More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0513 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  82.44 
 
 
284 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  82.28 
 
 
281 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  86.13 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  46.25 
 
 
250 aa  233  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  48 
 
 
277 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  49.79 
 
 
268 aa  224  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  45.34 
 
 
246 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  52.45 
 
 
278 aa  221  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  44.76 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  49.79 
 
 
242 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  50.47 
 
 
262 aa  218  7e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 
295 aa  216  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  48.7 
 
 
246 aa  215  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  47.88 
 
 
244 aa  214  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  48.95 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  45.19 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  44.98 
 
 
253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  53.14 
 
 
296 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  49.31 
 
 
276 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  51.43 
 
 
301 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  42.91 
 
 
253 aa  208  9e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  43.55 
 
 
254 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  48.53 
 
 
283 aa  203  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  47.85 
 
 
300 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 
234 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  47.64 
 
 
231 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 
224 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  43.36 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  43.36 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  49.77 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  42.75 
 
 
283 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  48.29 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 
289 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  48.18 
 
 
305 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  42.01 
 
 
283 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  48.18 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.11 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  43.31 
 
 
328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  46.33 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  42.05 
 
 
294 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  42.07 
 
 
279 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  47.25 
 
 
407 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 
254 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  48.77 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  48.29 
 
 
253 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  47.32 
 
 
281 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 
292 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  47.32 
 
 
277 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 
297 aa  195  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  48.28 
 
 
264 aa  194  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.32 
 
 
252 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  46.38 
 
 
273 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 
293 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  47.32 
 
 
281 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  50.42 
 
 
308 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  40.64 
 
 
323 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  48.77 
 
 
253 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.54 
 
 
264 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  47.32 
 
 
285 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.49 
 
 
252 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 
326 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 
269 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  45.24 
 
 
321 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 
322 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  46.41 
 
 
319 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 
227 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 
281 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 
313 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.62 
 
 
283 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  43.95 
 
 
258 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  42.58 
 
 
269 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  40.44 
 
 
225 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  42.8 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  48.08 
 
 
277 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  45.83 
 
 
312 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  41.38 
 
 
248 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 
303 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  44.5 
 
 
352 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  43.4 
 
 
226 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 
239 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 
303 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  45.67 
 
 
253 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  41.83 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  46.51 
 
 
313 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  42.35 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  42.35 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>