More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1398 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  49.6 
 
 		 277 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  51.69 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  52.45 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  51.87 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  56.65 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  54.68 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  44.66 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  47.46 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  51.98 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  52.28 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  47.64 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  46.8 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  47.46 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  53.43 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  51.64 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  44.62 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  51.08 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  46.81 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  52.97 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.9 
 
 		 303 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  47.01 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  46.77 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  48.03 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  48.08 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  50.93 
 
 		 282 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  44.4 
 
 		 321 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  51.78 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  43.72 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  48.42 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  50.49 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  42.6 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  46.98 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  47.37 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  43.94 
 
 		 268 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  52.53 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  49.49 
 
 		 218 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.86 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  46.73 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  47.94 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  46.54 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  49.49 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  45.11 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  50.49 
 
 		 301 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  45.34 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  45.45 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  42.91 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.45 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  42.91 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  45.87 
 
 		 315 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  49.49 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.22 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  43.65 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  44.93 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  42.41 
 
 		 303 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  44.93 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  45.41 
 
 		 267 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  47.76 
 
 		 322 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.88 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  48.43 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  44.64 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  45.83 
 
 		 312 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  46.92 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  44.7 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  48.28 
 
 		 394 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  42.05 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  44.19 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  44.5 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>