More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3881 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 217 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.97 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.97 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.97 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.97 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.72 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.74 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.49 
 
 		 290 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  50.98 
 
 		 300 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  53.33 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  50.73 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  47.39 
 
 		 219 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  46.4 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  48.17 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  47.88 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  45.5 
 
 		 394 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.82 
 
 		 303 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  51.35 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  47.03 
 
 		 284 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  48.19 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  47.03 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  49.27 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  49.01 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  49.01 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.29 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  51.05 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  44.34 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.74 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  45.13 
 
 		 288 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  46.05 
 
 		 296 aa  194  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  47.28 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  49.5 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.92 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  49.02 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  46.92 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  47.6 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  42.54 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  48.76 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  48.76 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  48.76 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  45.63 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  47.26 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  45.89 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  50.83 
 
 		 326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  46.53 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  43 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  47.83 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  48.51 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  50.53 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  45.15 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  47.28 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  45.15 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  46.67 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  42.49 
 
 		 267 aa  187  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  45.27 
 
 		 279 aa  187  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  44.66 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  41.45 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  47.03 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  50.26 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  45.62 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  46.83 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1285  hydrogenase accessory protein HypB  44.35 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  47.37 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  46.05 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  44.93 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  46.89 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  46.39 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  48.09 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>