More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1274 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  71.64 
 
 		 268 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  67.16 
 
 		 283 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  65.27 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  67.98 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  70.83 
 
 		 296 aa  318  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  55.64 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  52.8 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  53.94 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  54.58 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  52.89 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  53.31 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  53.09 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  57.48 
 
 		 278 aa  252  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  55.45 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  57.48 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  54.3 
 
 		 352 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  54.21 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  49.8 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  53.33 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  51.41 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  55.87 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  54.13 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  54.13 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  49.23 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  49.4 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  54.13 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  54.13 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  49.22 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  52.23 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  51.21 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  50.6 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  52.38 
 
 		 224 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  51.4 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  50.81 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  55.11 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  46.43 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  50.63 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  56.34 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  52.4 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  49.42 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  49.42 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  49.6 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  56.67 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  54.67 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  50.61 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  56.68 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  54.93 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  57.62 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  47.96 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  52.75 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  56.52 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  50.71 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  50.93 
 
 		 220 aa  221  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 286 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.37 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  54.88 
 
 		 407 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  53.02 
 
 		 394 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  48.61 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  50.61 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  46.98 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  54.68 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  54.68 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  51.43 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  53.67 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.52 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  50.21 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.08 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.79 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.79 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.02 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  57.08 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.79 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  49.06 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.97 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  55.67 
 
 		 251 aa  215  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 		 280 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  53.96 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  51.14 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.08 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  54.25 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  51.13 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  46.64 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  53.49 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  53.42 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.57 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  48.17 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>