More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0504 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  96.25 
 
 
284 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  96.08 
 
 
281 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  88.94 
 
 
271 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  46.83 
 
 
250 aa  241  7.999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  46.43 
 
 
277 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  46.59 
 
 
247 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  47.18 
 
 
246 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  46.99 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  48.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 
270 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  48.94 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 
286 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 
262 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  51.47 
 
 
278 aa  215  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  46.24 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  52.86 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 
244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  47.48 
 
 
244 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  51.71 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  43.7 
 
 
253 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  43.82 
 
 
253 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 
283 aa  209  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 
276 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 
235 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  47.35 
 
 
246 aa  208  8e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  49.08 
 
 
407 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  44.65 
 
 
279 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 
224 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 
230 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 
234 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  49.09 
 
 
297 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  47.71 
 
 
394 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  43.09 
 
 
254 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  45.61 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.69 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  41.81 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 
300 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 
292 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  47.79 
 
 
305 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  42.74 
 
 
258 aa  198  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 
254 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  49.06 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  44.59 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  44.78 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 
282 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  47.79 
 
 
257 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  42.8 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  43.75 
 
 
294 aa  195  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 
227 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  47.6 
 
 
252 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  44.87 
 
 
273 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.91 
 
 
252 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  47.39 
 
 
303 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 
269 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  49.06 
 
 
313 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  41.51 
 
 
225 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  47.66 
 
 
308 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  41.8 
 
 
266 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  41.8 
 
 
267 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 
326 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  46.41 
 
 
293 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.75 
 
 
290 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.75 
 
 
290 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.75 
 
 
290 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.75 
 
 
290 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.86 
 
 
283 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.08 
 
 
252 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  42.62 
 
 
253 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  42.34 
 
 
267 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 
323 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 
281 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 
225 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  45.28 
 
 
290 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  44.76 
 
 
321 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 
269 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 
322 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  45.45 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 
251 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  45.67 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.28 
 
 
290 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 
281 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  44.55 
 
 
283 aa  188  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>