More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2043 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 253 aa  524  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  64.18 
 
 		 266 aa  348  3e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  61.81 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  58.96 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  61.51 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  56.18 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  55.91 
 
 		 277 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  60.16 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  65 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  62.86 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  62.45 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  55 
 
 		 278 aa  305  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  63.27 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  63.88 
 
 		 285 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  57.94 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  61.94 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  64.29 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  54.17 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  52.94 
 
 		 270 aa  293  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  57.94 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  55.24 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  51.79 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  52.59 
 
 		 244 aa  265  8e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  47.37 
 
 		 283 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  52.59 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  52.99 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  51 
 
 		 268 aa  248  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  50.41 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  49.8 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  54.81 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  52.07 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  46 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  43.02 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  45.31 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  45.31 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  48.18 
 
 		 308 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  51.4 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  42.35 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  45.11 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.32 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  43.82 
 
 		 284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  43.82 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  45.63 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.34 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.91 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  47.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  47.39 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  40.84 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  41.51 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  43.82 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  45.85 
 
 		 407 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  43.61 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  47.25 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  42.91 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  39.65 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  45.33 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  44.54 
 
 		 322 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  46.05 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  42.98 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  42.35 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.56 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  47.98 
 
 		 313 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  44.62 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.02 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  40.21 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.02 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  43.64 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  44.1 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.02 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.02 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 217 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  40.35 
 
 		 289 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  45.41 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  42.13 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  44.8 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  42.69 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.59 
 
 		 290 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  45.87 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  38.78 
 
 		 267 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>