More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1765 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 264 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  71.27 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  71.43 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  65.3 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  67.29 
 
 		 270 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  68.28 
 
 		 269 aa  363  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  59.93 
 
 		 275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  49.65 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  48.28 
 
 		 267 aa  267  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  44.04 
 
 		 352 aa  265  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  47.79 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  45.18 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  46.9 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.57 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  45.04 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  44.68 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  57.28 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  46.24 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.24 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  46.62 
 
 		 293 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 326 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  43.94 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.9 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.9 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.9 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  49.22 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  49.22 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  44.34 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  58.69 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  47.96 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  59.07 
 
 		 407 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.55 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  53.66 
 
 		 394 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  44.01 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.86 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  56.28 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  47.35 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.21 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  41.9 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  56.28 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  45.95 
 
 		 345 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  55.81 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  55.24 
 
 		 303 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1285  hydrogenase accessory protein HypB  44.16 
 
 		 345 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  56.81 
 
 		 254 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  53.24 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  48.75 
 
 		 328 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  42.95 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  48.85 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  53.37 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  55.3 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  46.02 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  46.64 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  48.5 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.58 
 
 		 303 aa  231  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  52.56 
 
 		 321 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  53.33 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  44.76 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  45.59 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  43.84 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  47.67 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  46.9 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  44.56 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  46.9 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  45.91 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.91 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  49.78 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  48.85 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  47.88 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.53 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  43.71 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  53.24 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 220 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  53.3 
 
 		 318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.06 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  42.21 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1174  hydrogenase accessory protein HypB  55.66 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  43.4 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 218 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  47.12 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  39.06 
 
 		 296 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  41.79 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  42.75 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  42.98 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  41.92 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>