293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1213 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  97.24 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  94.93 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  54.76 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  54.07 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  52.07 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  50.71 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  52.17 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  46.54 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 286 aa  221  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  48.61 
 
 		 277 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 297 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  52.63 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  46.92 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 322 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.62 
 
 		 303 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  48.15 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  48.56 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  47.87 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  49.06 
 
 		 407 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.95 
 
 		 290 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.42 
 
 		 290 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  48.83 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.79 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.95 
 
 		 290 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  46.12 
 
 		 226 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.83 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 244 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  47.03 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  49.32 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  46.05 
 
 		 269 aa  202  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  46.63 
 
 		 261 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  46.63 
 
 		 261 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 257 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 		 352 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  48.31 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  49 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  47.22 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 326 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  46.15 
 
 		 263 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  48.54 
 
 		 292 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  47.87 
 
 		 307 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  47.34 
 
 		 319 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  47.64 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  47.39 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  46.23 
 
 		 394 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 283 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  47.12 
 
 		 295 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  46.41 
 
 		 313 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  45.93 
 
 		 279 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  47.6 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  45.41 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 292 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 264 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  49.75 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  51.96 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  45.89 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  46.95 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  48.08 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  44.55 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>