More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3219 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  69.66 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  62.3 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  56.14 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.59 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.59 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.59 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.59 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 217 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  55.35 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 218 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  51.53 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.76 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  48.18 
 
 		 322 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  51.89 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  47.5 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  51.66 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  47.85 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  47.27 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  48.89 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  48.85 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.59 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  43.37 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  51.36 
 
 		 223 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  50.68 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 283 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  52.56 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  48.43 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  49.21 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  45.38 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  52.29 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  48.52 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  48.8 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  52.56 
 
 		 282 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  46.77 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  45.53 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  52 
 
 		 407 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  44.34 
 
 		 220 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  44.75 
 
 		 266 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  44.75 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 277 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  47.98 
 
 		 307 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  42.74 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  44.98 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  49.55 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  51.42 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  48.61 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  41.91 
 
 		 281 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  47.01 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  44.03 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.92 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  45.04 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.75 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  41.11 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  44.35 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  41.11 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.92 
 
 		 252 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 252 aa  198  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  48.83 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  49.34 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  51.17 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  48.91 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>