More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0298 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  54.38 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  50.92 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  52.27 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  51.64 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  48.86 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  52.83 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  49.09 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  50.93 
 
 		 297 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  48.42 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  53.39 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  53.39 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  50.69 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  48.62 
 
 		 352 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  48.85 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  45.21 
 
 		 218 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  50.23 
 
 		 289 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  47.91 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  48.4 
 
 		 277 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  50.23 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 305 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  50.97 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 300 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  51.13 
 
 		 273 aa  207  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  48.17 
 
 		 326 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 261 aa  207  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.95 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 292 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  52.58 
 
 		 282 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  47.71 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  46.54 
 
 		 301 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  48.54 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  49.55 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  42.53 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  43.38 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  44.95 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.52 
 
 		 290 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  45.97 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  48.39 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 312 aa  201  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  48.4 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  52.45 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.52 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  47.66 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  46.61 
 
 		 296 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 267 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  46.79 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  47.71 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  46.95 
 
 		 270 aa  198  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 		 303 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 		 216 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  45.79 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  46.76 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  47.69 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  46.51 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 319 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.61 
 
 		 264 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  43.3 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 275 aa  193  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 394 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  47 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 267 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  41.86 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  47.64 
 
 		 407 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>