More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3807 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  83.98 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  74.65 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  61.21 
 
 		 227 aa  278  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  57.14 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  53.43 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  50.47 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  49.33 
 
 		 313 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 286 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  43.66 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.25 
 
 		 303 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 		 277 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.82 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.82 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.82 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.82 
 
 		 290 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  43.46 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  47.73 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  51.38 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  44.04 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 289 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  47.73 
 
 		 289 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  47.51 
 
 		 300 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  44.04 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.36 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  46.76 
 
 		 271 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.91 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  43.72 
 
 		 352 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  47.49 
 
 		 319 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 407 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  46.86 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 281 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  44.7 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.95 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  46.33 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  46.95 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  42.4 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.23 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  47.69 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  45.33 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  46.3 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 261 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 312 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  50.94 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  45.28 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  41.71 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 303 aa  187  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  47.57 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  44.24 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  41.71 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  42.4 
 
 		 307 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  41.59 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  41.01 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  46.41 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  44.5 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 		 308 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  41.12 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  44.81 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  40.19 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  41.59 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  41.42 
 
 		 345 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  46.57 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  41.74 
 
 		 328 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  42.33 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  44.98 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  43.26 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>