More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0726 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  97.57 
 
 		 247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  96.36 
 
 		 246 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  72.36 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  64.78 
 
 		 250 aa  322  5e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  58.67 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  58.94 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  63.48 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  56.34 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  55.56 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  57.49 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  50.94 
 
 		 266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  57.5 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  56.43 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  54.9 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  55 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  55.69 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  51.47 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  52.59 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  50.36 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  53.69 
 
 		 277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  58.23 
 
 		 253 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  50.82 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  51.04 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  52.06 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  57.81 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  49.82 
 
 		 281 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  58.23 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  48.77 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  55.24 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  57.29 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  49.59 
 
 		 308 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.04 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.21 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  47.92 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  46.59 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  47.11 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  48.52 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  50.93 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  47.86 
 
 		 292 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  51.46 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  46.59 
 
 		 280 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  49.54 
 
 		 301 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  48.83 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  41.64 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  47.19 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.09 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  46.36 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  44 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  44 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 267 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  47.25 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  51.94 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.65 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  44.76 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  44.36 
 
 		 303 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 313 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  50.48 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 307 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.06 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  46.35 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  46.58 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  48.62 
 
 		 407 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  46.52 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45.83 
 
 		 352 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  47.69 
 
 		 306 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  46.67 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  45.25 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  49.5 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  44.55 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 318 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  38.14 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  43.61 
 
 		 326 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  41.99 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  43.03 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  44.93 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>