95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0182 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  100 
 
 		 402 aa  808    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  56.19 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  50.74 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  51.24 
 
 		 404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.7 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.6 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.23 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  47.78 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.37 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.27 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  48.4 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.88 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.98 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  48.51 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  48.52 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  47.28 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  46.44 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.67 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  48.11 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  45.3 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  43.81 
 
 		 383 aa  316  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  45.68 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.52 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.66 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.52 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.55 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.5 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.42 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.07 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.7 
 
 		 419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.28 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 409 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.14 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.19 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.97 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.33 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.97 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  29.78 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.2 
 
 		 426 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.69 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.68 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.31 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.69 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  23.6 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  22.78 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.41 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  21.1 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  23.12 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  38.24 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  30.59 
 
 		 490 aa  46.6  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  31.4 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  31.43 
 
 		 486 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  32.29 
 
 		 521 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  30.88 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  32 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  29.9 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf597  phosphoglyceromutase  31.52 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000713126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  25.24 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  29.47 
 
 		 504 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  30.85 
 
 		 540 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 506 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  30.69 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  30.69 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  30.85 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>