96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0684 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  95.57 
 
 
406 aa  794    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  81.77 
 
 
406 aa  694    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  93.84 
 
 
406 aa  777    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 
406 aa  822    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  72.17 
 
 
406 aa  617  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  47.32 
 
 
409 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.52 
 
 
411 aa  359  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.3 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.21 
 
 
429 aa  330  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
411 aa  322  6e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 
411 aa  322  7e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 
411 aa  320  3e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.07 
 
 
411 aa  318  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  41.12 
 
 
414 aa  316  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  44.63 
 
 
406 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 
413 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 
401 aa  255  9e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  36.52 
 
 
401 aa  245  8e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.05 
 
 
426 aa  233  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.09 
 
 
409 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 
401 aa  229  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
401 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 
401 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.63 
 
 
419 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  34.84 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
409 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  35.78 
 
 
392 aa  215  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.25 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.47 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.61 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.62 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
397 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  36.15 
 
 
383 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 
401 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
399 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
398 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  34.42 
 
 
383 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  32.94 
 
 
403 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  34.72 
 
 
405 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
399 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
387 aa  203  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
398 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
409 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.59 
 
 
403 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.9 
 
 
432 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.33 
 
 
426 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33 
 
 
426 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.35 
 
 
426 aa  189  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
397 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.23 
 
 
393 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
426 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.31 
 
 
398 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  33.33 
 
 
402 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 
393 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  32.12 
 
 
402 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 
402 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.56 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.95 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  29.85 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
404 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 
428 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  28.2 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  24.3 
 
 
392 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 
428 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 
421 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 
501 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
501 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  30.09 
 
 
490 aa  50.4  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  23.49 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  27.35 
 
 
297 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  24.24 
 
 
518 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  23.66 
 
 
509 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  28.83 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  29.79 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  25.9 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf597  phosphoglyceromutase  22.54 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000713126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  24.09 
 
 
514 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  27.66 
 
 
504 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  25.37 
 
 
515 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  25.37 
 
 
515 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  30 
 
 
532 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  30 
 
 
532 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  25.83 
 
 
541 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  30.11 
 
 
508 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>