103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2464 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 399 aa  825    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  67.67 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  68.09 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  69.42 
 
 		 398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  64.41 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  64.16 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  64.41 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.16 
 
 		 401 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  55.69 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.25 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  51.24 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  50.63 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.87 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  55.32 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  49.25 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  52.39 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  49.25 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  50.51 
 
 		 384 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  51.36 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  47.87 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  53.2 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  49.63 
 
 		 387 aa  368  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  51.37 
 
 		 383 aa  362  9e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  49.23 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.39 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.39 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.89 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  45.05 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.7 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.65 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.47 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.21 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.31 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 406 aa  215  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.34 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.15 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.91 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.78 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.08 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.51 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.56 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.55 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.05 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.38 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  29.43 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.07 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.39 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.53 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.8 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.65 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 401 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.25 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  23.64 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  28.42 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  27.8 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  21.88 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  33.07 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  31.01 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  23.32 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  34.58 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  32.11 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  29.33 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  45.61 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  36.51 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  26.83 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  27.94 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  23.19 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  28 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  26.67 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  31.51 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  30.71 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  43.33 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.51 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  28.95 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  26.72 
 
 		 372 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  29.03 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>