88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1234 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  94.58 
 
 		 406 aa  783    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  79.8 
 
 		 406 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  93.84 
 
 		 406 aa  777    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 406 aa  822    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  72.91 
 
 		 406 aa  618  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  47.07 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  46.59 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.3 
 
 		 411 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.18 
 
 		 429 aa  324  1e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  45.12 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 411 aa  316  4e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 		 411 aa  316  4e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.19 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.19 
 
 		 411 aa  315  8e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.88 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  37.75 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.54 
 
 		 426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.39 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.83 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.58 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.83 
 
 		 401 aa  226  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  34.51 
 
 		 384 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.01 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  35.29 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.86 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.31 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.38 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.49 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  36.29 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  32.19 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  34.67 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.1 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  34.62 
 
 		 405 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 397 aa  196  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.81 
 
 		 432 aa  192  6e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.09 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.37 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.5 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  33.58 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  32.6 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.95 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.28 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.56 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  30.59 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  23.72 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  27.76 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  23.48 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  31.4 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  29.47 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  28.42 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  26.97 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  27.59 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  23.66 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  27.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  23.02 
 
 		 513 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  25.17 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  29.6 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  33.77 
 
 		 487 aa  42.7  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>