78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2656 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 		 411 aa  832    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  63.17 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  61.22 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.43 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.99 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 406 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.3 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.3 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.2 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  41.93 
 
 		 409 aa  316  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.18 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.53 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.01 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.77 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 409 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.53 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.89 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  35.61 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 403 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  34.41 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.76 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  35.71 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  34.62 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  33.75 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  36.91 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.34 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.96 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  31.16 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.92 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 397 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  35.64 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  34.07 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.73 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.41 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.19 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.27 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.42 
 
 		 433 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  33.42 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.11 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  31.11 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.74 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.89 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.14 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.94 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  23.5 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  24.11 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  23.37 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  26.68 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  27.96 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>