96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1058 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  100 
 
 		 405 aa  819    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  52.62 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  57.32 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  52.61 
 
 		 403 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  56.19 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  50.87 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.59 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  55.69 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.09 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.1 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.55 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.58 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.36 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  52.1 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.36 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  51.74 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  50.91 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.69 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  47.13 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  46.15 
 
 		 385 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.95 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  46.91 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  46.01 
 
 		 387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  43.28 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.72 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.7 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.23 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 406 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.91 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.5 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.08 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.41 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.44 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.83 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.98 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.61 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  27.79 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  29.57 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.68 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.27 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.25 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  24.13 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.19 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.69 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  22.46 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.93 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  22.49 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  20.06 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  20.05 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  30.89 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  36.89 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  27.89 
 
 		 339 aa  53.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  36.08 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  22.4 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  26.74 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  34.02 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  34.02 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  32.88 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  27.86 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  33.85 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  30.88 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  33.85 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  35.38 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  32.84 
 
 		 492 aa  43.5  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  32.35 
 
 		 540 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  41.38 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  30.84 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>