74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1620 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  83.41 
 
 		 428 aa  764    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  81.31 
 
 		 428 aa  735    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 428 aa  872    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  56.18 
 
 		 429 aa  498  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  47.45 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  43.12 
 
 		 426 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.82 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  41.96 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.47 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.37 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.74 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.31 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 406 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.25 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.2 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.57 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.39 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.76 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.7 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  24.76 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.34 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.5 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.18 
 
 		 401 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  26.81 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  24.81 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.28 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  26.45 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  24.56 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.18 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.07 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.78 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.24 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.04 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  23.08 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.06 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.56 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  23.71 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  24.58 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.45 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.74 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.59 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  22.49 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.82 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  22.7 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  24.42 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  25.18 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  22.78 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.24 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.21 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  18.33 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  21.68 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>