133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1474 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  79.32 
 
 
411 aa  692    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  83.7 
 
 
411 aa  708    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  82.97 
 
 
411 aa  709    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 
411 aa  820    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.17 
 
 
414 aa  345  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
406 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
406 aa  322  8e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
406 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.37 
 
 
413 aa  316  4e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
406 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.13 
 
 
429 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.92 
 
 
409 aa  293  4e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.59 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 
406 aa  275  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.66 
 
 
409 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.65 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.71 
 
 
426 aa  256  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
409 aa  252  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 
401 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.22 
 
 
419 aa  242  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 
401 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
395 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  37.84 
 
 
401 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
401 aa  235  8e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.41 
 
 
421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 
403 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
402 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.73 
 
 
402 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
403 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
409 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  33.17 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  34.5 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.08 
 
 
385 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  33.92 
 
 
384 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
398 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
401 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.9 
 
 
426 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  33.59 
 
 
383 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  32.66 
 
 
407 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.54 
 
 
432 aa  179  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 
399 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  34.85 
 
 
402 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.25 
 
 
399 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
398 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
399 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
397 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.98 
 
 
396 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.79 
 
 
393 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.05 
 
 
398 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
402 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 
426 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  31.98 
 
 
405 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  30.25 
 
 
403 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
404 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
399 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
393 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.86 
 
 
426 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.08 
 
 
426 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.03 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.31 
 
 
402 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  30.03 
 
 
402 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
428 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  23.82 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 
428 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
378 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  28 
 
 
514 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  28 
 
 
514 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  32.35 
 
 
521 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  29.29 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  29.29 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  29.29 
 
 
514 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  27.2 
 
 
514 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  27.2 
 
 
514 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  30.33 
 
 
514 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  30.33 
 
 
514 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
514 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  29.6 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  31.62 
 
 
338 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  29.32 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  30.77 
 
 
338 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  26.67 
 
 
513 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  32.52 
 
 
504 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  25.87 
 
 
513 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  28.91 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  28.91 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  29.69 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>