86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1043 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 
411 aa  828    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  78.83 
 
 
411 aa  689    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  82.73 
 
 
411 aa  723    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  79.32 
 
 
411 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.89 
 
 
414 aa  352  7e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 
406 aa  329  7e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.27 
 
 
406 aa  319  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.07 
 
 
406 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 
413 aa  317  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 
406 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 
406 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.61 
 
 
409 aa  310  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.3 
 
 
429 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.32 
 
 
411 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 
406 aa  292  8e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.53 
 
 
411 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.93 
 
 
409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 
395 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.9 
 
 
401 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  36.74 
 
 
409 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.59 
 
 
426 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.21 
 
 
419 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  38.4 
 
 
401 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.01 
 
 
401 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.77 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.65 
 
 
421 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.07 
 
 
402 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 
401 aa  226  6e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.34 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 
402 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
428 aa  217  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
387 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
408 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  35.32 
 
 
384 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  33.67 
 
 
392 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.75 
 
 
385 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
398 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  32.41 
 
 
383 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.25 
 
 
426 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.16 
 
 
432 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
401 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  32.65 
 
 
383 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  32.49 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.02 
 
 
401 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
397 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
399 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
393 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
393 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
399 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
399 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
398 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 
397 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.56 
 
 
433 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  29.54 
 
 
403 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  33.07 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.05 
 
 
396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.89 
 
 
426 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
404 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.37 
 
 
398 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.89 
 
 
426 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  29.98 
 
 
405 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  27.72 
 
 
402 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  27.59 
 
 
402 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
428 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
428 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  26.65 
 
 
428 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  24.5 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
378 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  41.44 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  26.24 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  30 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  31.25 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  31.15 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  29.23 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  29.07 
 
 
514 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  30.93 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  29.31 
 
 
317 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  30.21 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>