123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2477 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  100 
 
 
317 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  95.27 
 
 
338 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  95.27 
 
 
338 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  76.06 
 
 
308 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  35.93 
 
 
294 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  34.45 
 
 
297 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  36.61 
 
 
284 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  44.18 
 
 
312 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  42.97 
 
 
312 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  36.54 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  37.59 
 
 
312 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  40.24 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  33.72 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  30.69 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  34.51 
 
 
311 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  33.9 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  37.37 
 
 
411 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  42.86 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  42.86 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  43.28 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  29.69 
 
 
516 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 
525 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  32.87 
 
 
507 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  44.78 
 
 
407 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  28 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  30.23 
 
 
519 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  28.24 
 
 
491 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  34.33 
 
 
402 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  30.47 
 
 
510 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  30.47 
 
 
529 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  30.97 
 
 
508 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 
512 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  29.1 
 
 
505 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  25.36 
 
 
509 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  29.66 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 
512 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
511 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  28.03 
 
 
514 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  35.34 
 
 
392 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  27.67 
 
 
510 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  29.69 
 
 
492 aa  46.6  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  24.86 
 
 
501 aa  46.6  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  29.66 
 
 
514 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  29.66 
 
 
514 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  37.35 
 
 
394 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  43.28 
 
 
405 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  28.93 
 
 
514 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  28.93 
 
 
514 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  28.93 
 
 
514 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
411 aa  45.8  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  32 
 
 
504 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  30.09 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  23.53 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  30.09 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  28.35 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  31.33 
 
 
504 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  30.97 
 
 
510 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  28.97 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  26.96 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 
509 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
511 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 
509 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  29.01 
 
 
513 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  25.44 
 
 
492 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  29.23 
 
 
509 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  27.86 
 
 
514 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  24.56 
 
 
492 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  25.71 
 
 
501 aa  43.9  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  31.4 
 
 
506 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  31.4 
 
 
506 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  28.72 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  30.83 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  26.09 
 
 
515 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  38.03 
 
 
406 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
512 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
411 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 
505 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 
505 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>