27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4288 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  78.04 
 
 		 312 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  55.66 
 
 		 310 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  40.21 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  36.9 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  39.46 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  31.38 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  37.5 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  29.25 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  38.41 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  30.65 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  36.51 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  38.44 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  33.89 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  36.88 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  30.95 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 514 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  44 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  32.41 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  32.65 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  31 
 
 		 512 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  29.06 
 
 		 517 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  47.5 
 
 		 509 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  47.5 
 
 		 509 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  35.29 
 
 		 411 aa  42.4  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  34.55 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>