192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0228 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  37.26 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  39.51 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  35.06 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  35.88 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  34.81 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  40.21 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  34.9 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  33.78 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  36.05 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  33.8 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  33.97 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  31.56 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  28.28 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  28.87 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  29.51 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  26.92 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  32.08 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  25.4 
 
 		 517 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  31.78 
 
 		 504 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  29.27 
 
 		 504 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  28.46 
 
 		 504 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  27.87 
 
 		 510 aa  52.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  29.25 
 
 		 514 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  29.25 
 
 		 506 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  27.36 
 
 		 511 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 509 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 		 507 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  27.36 
 
 		 511 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  30.19 
 
 		 512 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 506 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  28.12 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 510 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  27.2 
 
 		 520 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  33.02 
 
 		 510 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  32.08 
 
 		 514 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  25.47 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  25.66 
 
 		 532 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  29.52 
 
 		 507 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 506 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  34.18 
 
 		 511 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  27.36 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  29.25 
 
 		 513 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 508 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  27.64 
 
 		 509 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 		 509 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 513 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  26.02 
 
 		 514 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  26.19 
 
 		 514 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 510 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 511 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  26.02 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  26.02 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  26.02 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  26.95 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  26.02 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  26.09 
 
 		 491 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  25.58 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  26.83 
 
 		 552 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  28.24 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  24.53 
 
 		 511 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  25.47 
 
 		 511 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.31 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  24.53 
 
 		 511 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 529 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0513  phosphoglyceromutase  31.65 
 
 		 545 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.272829  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 501 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 		 522 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.09 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  27.36 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  30.56 
 
 		 521 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  25.47 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 538 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  27.5 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  25.47 
 
 		 510 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 521 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  34.62 
 
 		 516 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 515 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  28.7 
 
 		 510 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  26.42 
 
 		 515 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  34.62 
 
 		 516 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 524 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 		 545 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  34.21 
 
 		 394 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  28.85 
 
 		 505 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>