256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2087 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  55.21 
 
 		 297 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  41.52 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  37.26 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  33.77 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  35.49 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  34.43 
 
 		 338 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  36.52 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  34.24 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  31.49 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  31.03 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  30.16 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  30.5 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  28.86 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  29.69 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  27.88 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  31.48 
 
 		 513 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0513  phosphoglyceromutase  33.9 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.272829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  26.23 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  28.83 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  30.28 
 
 		 510 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  28.95 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  29.69 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  26.19 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  31.53 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  32.14 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  24 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1340  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.157203  hitchhiker  0.0000000230825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  27.93 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  26.18 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  33.02 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  24.59 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  27.19 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  27.03 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  32.76 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  35.09 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  30.99 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  31.78 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  28.44 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  30.17 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  30.28 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  28.44 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  26.36 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  31.19 
 
 		 510 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  31.48 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 		 501 aa  57  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  31.09 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  25.45 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  25.6 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 511 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  25.6 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  29.73 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  32.43 
 
 		 532 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  30.28 
 
 		 529 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  26.19 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  31.19 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  29.36 
 
 		 515 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  28.7 
 
 		 509 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  29.52 
 
 		 507 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 501 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  32.46 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 508 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  25.81 
 
 		 504 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  31.19 
 
 		 512 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  29.36 
 
 		 515 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  27.97 
 
 		 511 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 516 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  30.09 
 
 		 525 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  31.09 
 
 		 540 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 530 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  32.46 
 
 		 532 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 505 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  32.11 
 
 		 514 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  29.36 
 
 		 511 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  32.46 
 
 		 532 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  29.63 
 
 		 516 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 520 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  32.46 
 
 		 532 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  31.19 
 
 		 512 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  32.11 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 514 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  28.04 
 
 		 512 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  30.89 
 
 		 547 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 		 532 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  27.1 
 
 		 512 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  24.6 
 
 		 516 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>