203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0175 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  55.21 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  46.44 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  35.71 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  35.06 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  33.66 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  33.99 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  35.46 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  33.11 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  30.27 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  31.46 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  29.25 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  28.92 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  29.03 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  30.48 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  27.11 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  32.23 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 507 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  28.69 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  32.73 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  30.83 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  25.23 
 
 		 509 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  28.83 
 
 		 505 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  31.93 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  31.67 
 
 		 520 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  32.14 
 
 		 532 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 511 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 513 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  26.4 
 
 		 506 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  30.97 
 
 		 516 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  29.41 
 
 		 515 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  29.41 
 
 		 515 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  26.4 
 
 		 506 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  27.93 
 
 		 512 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 		 517 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  29.17 
 
 		 519 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  28.21 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  29.47 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  28.83 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 511 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  32.71 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  29.75 
 
 		 514 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  30.17 
 
 		 511 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  29.09 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  28.68 
 
 		 514 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  34.91 
 
 		 492 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 504 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  25.95 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  25.93 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 504 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  28.83 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  30.84 
 
 		 516 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 		 514 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  26.56 
 
 		 516 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 514 aa  49.3  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  27.35 
 
 		 515 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  28.7 
 
 		 541 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0868  phosphoglyceromutase  29.75 
 
 		 506 aa  49.3  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  32.17 
 
 		 518 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 504 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  30.56 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  29.41 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 		 490 aa  48.5  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  27.52 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 509 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2472  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 		 528 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  27.74 
 
 		 540 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  27.12 
 
 		 540 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  30.91 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  33.33 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  32.73 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  33.33 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 		 521 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 511 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  26.85 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  32.73 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  26.5 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  31.36 
 
 		 519 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  29.94 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 506 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 513 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  27.03 
 
 		 505 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  31.19 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  31.36 
 
 		 519 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  31.19 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>