81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0933 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  78.04 
 
 		 312 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  57.61 
 
 		 310 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  38.39 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  39.51 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  41.14 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  41.07 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  39.93 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  31.07 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  31.49 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  41.48 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  30.27 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  41.96 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  39.67 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  34.11 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  30.51 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  46.48 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  40.91 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  35.24 
 
 		 514 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0277  phosphopentomutase  40.85 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  35.63 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  46 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  42.31 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  47.06 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  42 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  39.44 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  35.94 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  40 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  33.8 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  33.8 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  42 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  46.15 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1596  phosphopentomutase  38.03 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  44 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  46.15 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  42 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  40.32 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  42.31 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  45.1 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  36.62 
 
 		 394 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  37.04 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  42.31 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  30.37 
 
 		 420 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  35.19 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  32.32 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  28.03 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  37.78 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  40 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  32.88 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  29.67 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  31.43 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  38 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  31.51 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  31.37 
 
 		 504 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  38.46 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  38.46 
 
 		 393 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  39.22 
 
 		 406 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  30.34 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  30.39 
 
 		 504 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  37.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  31.73 
 
 		 504 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  39.22 
 
 		 406 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  42.31 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  36.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  32.91 
 
 		 411 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  35.19 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>