31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2265 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  100 
 
 
311 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  38.21 
 
 
275 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  34.4 
 
 
312 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  27.88 
 
 
294 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  27.11 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  38.15 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  24.44 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  30.51 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  30.61 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  31.7 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  28.87 
 
 
304 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  33.98 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  27.31 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  33.59 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  34.36 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  29.01 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  40.45 
 
 
496 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  31.07 
 
 
491 aa  46.2  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
510 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  30.84 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  30.84 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 
513 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  30.68 
 
 
514 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  30.48 
 
 
514 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 
517 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  30.48 
 
 
514 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  29.67 
 
 
512 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  29.73 
 
 
511 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  29.73 
 
 
511 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 
511 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>