122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1180 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  36.82 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  35.35 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  35.97 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  41.78 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  35.14 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  40.07 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  39.46 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  41.3 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  42.24 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  42.46 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  38.22 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  33.44 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  35.91 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  36.82 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  33.1 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  30.36 
 
 		 501 aa  65.9  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  26.89 
 
 		 514 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0513  phosphoglyceromutase  27.41 
 
 		 545 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.272829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  26.55 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  24.11 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  29.57 
 
 		 532 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  25.66 
 
 		 517 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 		 513 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  28.04 
 
 		 506 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 519 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 406 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 515 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 515 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 515 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  24.76 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  32.17 
 
 		 516 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  27.1 
 
 		 506 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  25.89 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.58 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  28.89 
 
 		 505 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  29.2 
 
 		 513 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 		 532 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  25.41 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  26.61 
 
 		 515 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  25 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  24.19 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  35.21 
 
 		 515 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  27.68 
 
 		 514 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  28.18 
 
 		 509 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  27.68 
 
 		 511 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  25.86 
 
 		 545 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  27.59 
 
 		 533 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05081  phosphoglyceromutase  26.96 
 
 		 540 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  27.68 
 
 		 511 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  29.36 
 
 		 532 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  26.79 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  29.31 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  24.59 
 
 		 511 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  25.83 
 
 		 540 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  29.63 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  27.62 
 
 		 506 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  27.62 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  25.44 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  29.27 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  26.79 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  26.67 
 
 		 529 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  24.77 
 
 		 517 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  30.28 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  22.33 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  26.77 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  31.68 
 
 		 516 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  26.92 
 
 		 516 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  26.55 
 
 		 511 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  26.55 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  25.89 
 
 		 514 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03059  hypothetical protein similar to cofactor-independent phosphoglycerate mutase (Eurofung)  27.78 
 
 		 520 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 		 516 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  27.52 
 
 		 514 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  25.64 
 
 		 519 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  25.64 
 
 		 519 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  29.81 
 
 		 521 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 		 516 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  31.3 
 
 		 516 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  26.05 
 
 		 522 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  26.17 
 
 		 509 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.27 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  26.61 
 
 		 514 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  25.89 
 
 		 510 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  25.89 
 
 		 511 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  24.8 
 
 		 514 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>