92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1107 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1107  metalloenzyme domain-containing protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2717  metalloenzyme domain protein  68.89 
 
 
272 aa  347  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.117696  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  35.86 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2265  metalloenzyme  38.21 
 
 
311 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  28.52 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0933  metalloenzyme domain-containing protein  35.34 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00156869  normal  0.10979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4541  metalloenzyme domain-containing protein  33.22 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  29.03 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  27.64 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1113  metalloenzyme domain protein  34.12 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000514956  unclonable  0.0000000445958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  28.72 
 
 
304 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4288  metalloenzyme domain-containing protein  33.81 
 
 
312 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00046152  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1390  metalloenzyme domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  32.69 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  33.33 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  30.79 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  36.54 
 
 
501 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  33.65 
 
 
501 aa  52.8  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  35.65 
 
 
505 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  30.88 
 
 
509 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  32.23 
 
 
507 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  33.96 
 
 
506 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 
506 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  31.78 
 
 
517 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  34.95 
 
 
515 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  34.95 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  34.95 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  31.9 
 
 
506 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  37.04 
 
 
540 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 
516 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  30 
 
 
540 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  32.77 
 
 
516 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  35.8 
 
 
540 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  32.74 
 
 
533 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  32.43 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_002978  WD0868  phosphoglyceromutase  36.47 
 
 
506 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  31.13 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
510 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  36.25 
 
 
540 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  33.98 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0513  phosphoglyceromutase  30.97 
 
 
545 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.272829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  31.09 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  30.56 
 
 
525 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  33.6 
 
 
522 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  31.78 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
510 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 
541 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 
519 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
510 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  32.04 
 
 
517 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 
519 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  31.53 
 
 
532 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  33.01 
 
 
514 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  33.01 
 
 
514 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  33.01 
 
 
514 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  35.9 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  33.01 
 
 
514 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  41.82 
 
 
552 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  34.62 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  41.82 
 
 
552 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  30.08 
 
 
514 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  40.91 
 
 
532 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  32.04 
 
 
514 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
532 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  34.48 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  29.36 
 
 
510 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  33.01 
 
 
514 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  34.62 
 
 
512 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  29.63 
 
 
519 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  33.01 
 
 
514 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  29.36 
 
 
513 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>