199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0333 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  100 
 
 		 408 aa  836    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  99.75 
 
 		 408 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  97.06 
 
 		 408 aa  812    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  836    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  97.79 
 
 		 408 aa  820    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  100 
 
 		 408 aa  836    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  99.51 
 
 		 408 aa  832    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  99.26 
 
 		 408 aa  830    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  67.24 
 
 		 411 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  54.64 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  44.64 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  33.03 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  29.1 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  28.94 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  30.58 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  29.57 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  27.94 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  27.08 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  28.23 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  29.95 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  29.19 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  29.13 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  27.13 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  30.43 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  30.37 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  28.83 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  27.42 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  27.42 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  27.42 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  29.41 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  27.42 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  27.92 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  28.15 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  29.46 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  26.67 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  27.75 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  27.75 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  30.18 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  30.32 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  27.4 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  27.19 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  29.46 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  26.65 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  28.9 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  27.29 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  27.44 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  29.06 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  26.95 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  28.05 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  28.95 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  28.95 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  28.77 
 
 		 407 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  27.69 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  29.02 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  28.82 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  28.96 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  29.81 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  28.96 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  28.74 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  28.34 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  28.57 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  30.82 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  28.57 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  28.57 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  28.57 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  27.69 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  28.34 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  31.04 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  28.71 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  28.34 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  28.25 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  27.98 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  27.66 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  26.44 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  27.69 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  29 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  28.54 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  28.61 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  27.53 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  28.6 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  28.11 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  27.23 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  26.44 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  28.67 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  29.25 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  28.67 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  28.51 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  30.63 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>