193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4006 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  100 
 
 		 411 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  68.22 
 
 		 408 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  67.48 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  67.24 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  67.24 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  67.24 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  67.48 
 
 		 408 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  66.99 
 
 		 408 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  67.24 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  54.3 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  47.17 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  28.02 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  27.74 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  28.31 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  27.46 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  28.37 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  27.79 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  27 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  28.31 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  30.39 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  28.02 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  27.21 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  27.21 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  27.21 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  27.21 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  27.21 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  27.49 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  26.98 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  26.98 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  27.83 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  26.83 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  26.83 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  26.98 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  26.98 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  26.95 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  26.35 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  28.4 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  29.29 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  29.05 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  26.76 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  27.64 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  26.83 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  26.1 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  27.32 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  27.32 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  27.36 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  27.57 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  28.19 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  27.72 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  28.21 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  25.58 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  27.93 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  27.31 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  27.6 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  27.59 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  25.33 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  25.41 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  27.38 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  27.38 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  25.6 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  27.59 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  27.8 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  26.4 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  27.15 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  27.59 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  27.59 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  26.73 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  26.73 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  27.94 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  27.46 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  27.62 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  29.14 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  25.99 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  26.11 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  26.32 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  28.29 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  27.27 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  27.43 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  27.17 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  26.77 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  24.76 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  27.8 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  27.03 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  24.62 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  25.93 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  27.63 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  26.77 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  26.8 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>