236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1838 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  100 
 
 
496 aa  1028    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  60.12 
 
 
491 aa  630  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  58.81 
 
 
487 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  59.43 
 
 
486 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 
492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 
492 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 
492 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 
492 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 
487 aa  551  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  49.3 
 
 
513 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  48.12 
 
 
510 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 
516 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.25 
 
 
516 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  44.76 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 
523 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  44.76 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  47.02 
 
 
512 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  46.23 
 
 
512 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  46.4 
 
 
515 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  45.47 
 
 
513 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07160  phosphoglyceromutase  46.44 
 
 
518 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000681979  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  44.86 
 
 
516 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
533 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  46.06 
 
 
511 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  46.71 
 
 
512 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  45.71 
 
 
511 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.97 
 
 
532 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  45.23 
 
 
508 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  46.59 
 
 
512 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  46.11 
 
 
512 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
532 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
515 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  45.55 
 
 
511 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  45.55 
 
 
511 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 
504 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  44.82 
 
 
511 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  45.14 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  45.84 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  45.22 
 
 
514 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.09 
 
 
510 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 
516 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  43.42 
 
 
516 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 
523 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 
516 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  45.47 
 
 
512 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  45.53 
 
 
512 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  43.37 
 
 
511 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 
529 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  46 
 
 
515 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 
542 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
507 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 
514 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  43.74 
 
 
521 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 
504 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 
532 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  44.42 
 
 
505 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  44.22 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  44.53 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  45.55 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  43.81 
 
 
542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  45.14 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  44.73 
 
 
513 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  44.67 
 
 
509 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  43.17 
 
 
509 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  44.11 
 
 
512 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  43.03 
 
 
516 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  44.82 
 
 
514 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  43.98 
 
 
521 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  43.74 
 
 
525 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 
506 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 
506 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
513 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  42.54 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  45.56 
 
 
532 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  43.55 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  43.93 
 
 
505 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  44.11 
 
 
514 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  43.82 
 
 
510 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
524 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  44.11 
 
 
514 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  44.15 
 
 
521 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  43.84 
 
 
506 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.5 
 
 
525 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  42.69 
 
 
517 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
506 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  42.42 
 
 
514 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
514 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  43.17 
 
 
518 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
514 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  42.35 
 
 
540 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  43.71 
 
 
506 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  42.63 
 
 
540 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  43.27 
 
 
516 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  41.19 
 
 
514 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  41.37 
 
 
516 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>