223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1360 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  63.29 
 
 
492 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  68.31 
 
 
487 aa  706    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  63.99 
 
 
487 aa  668    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  100 
 
 
487 aa  1004    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  62.47 
 
 
492 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  62.68 
 
 
492 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 
486 aa  662    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
492 aa  629  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  56.85 
 
 
496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  54.38 
 
 
491 aa  569  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
516 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
516 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  46.03 
 
 
512 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  45.88 
 
 
512 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  44.02 
 
 
513 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 
506 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 
512 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  45.11 
 
 
532 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  45.11 
 
 
532 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 
512 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  44.76 
 
 
505 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  44.82 
 
 
512 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  45.35 
 
 
510 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  45.02 
 
 
512 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 
510 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  44.27 
 
 
521 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  44 
 
 
510 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  47.11 
 
 
506 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  44.31 
 
 
532 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  45.63 
 
 
513 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
509 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  45.31 
 
 
514 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 
505 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  46.39 
 
 
511 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
510 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  44.76 
 
 
516 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  45.92 
 
 
512 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
512 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  46.18 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
511 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
509 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  45.51 
 
 
532 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 
511 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.11 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  44.33 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  43.74 
 
 
515 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  45.67 
 
 
511 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
515 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  43.34 
 
 
533 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  43.98 
 
 
525 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  43.8 
 
 
506 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  43.03 
 
 
516 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
511 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  45.76 
 
 
518 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 
512 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 
516 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07160  phosphoglyceromutase  43.2 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000681979  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 
516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  43.69 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  43.72 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  43.17 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  45.22 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  45.13 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  42.55 
 
 
525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  42.74 
 
 
511 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  44.31 
 
 
517 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  43.55 
 
 
508 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.84 
 
 
511 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
532 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  42.51 
 
 
504 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  43.71 
 
 
515 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  46.11 
 
 
511 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 
514 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  43.49 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  42.21 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
507 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  42.97 
 
 
524 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  44.22 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  43.75 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  43.96 
 
 
514 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  43.23 
 
 
505 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  42.07 
 
 
542 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  42.19 
 
 
525 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  43.96 
 
 
514 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  43.96 
 
 
514 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  45.51 
 
 
490 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  42.69 
 
 
514 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>