223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1593 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  65.3 
 
 
487 aa  675    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  63.24 
 
 
486 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  68.31 
 
 
487 aa  706    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  100 
 
 
487 aa  996    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  62.75 
 
 
492 aa  631  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  62.35 
 
 
492 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  62.35 
 
 
492 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 
492 aa  617  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  55.71 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  54.71 
 
 
496 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  46.6 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 
505 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.44 
 
 
516 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  47.12 
 
 
512 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
516 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  43.45 
 
 
516 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 
510 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  45.24 
 
 
510 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  44.24 
 
 
505 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 
510 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  43.25 
 
 
516 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
516 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  44.42 
 
 
513 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  45.02 
 
 
512 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  46.2 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  44.93 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 
532 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  43.45 
 
 
516 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  44.84 
 
 
532 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  43.4 
 
 
512 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  43.49 
 
 
513 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  42.71 
 
 
521 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  44.51 
 
 
512 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
532 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  43.34 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  42.83 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  43.23 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.64 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  43.65 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  44.06 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  43.74 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  43.69 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
509 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
509 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
509 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
509 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
509 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  44.18 
 
 
508 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 
506 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
514 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  43.43 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  43.43 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 
521 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
512 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  43.49 
 
 
521 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  43.43 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  41.14 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  44.04 
 
 
504 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  41.14 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  43.51 
 
 
511 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.05 
 
 
525 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  41.63 
 
 
515 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  43.43 
 
 
517 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  44.29 
 
 
511 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  43.03 
 
 
509 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  41.22 
 
 
507 aa  396  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  43.11 
 
 
515 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  43.74 
 
 
516 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  42.94 
 
 
529 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  43.49 
 
 
511 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  42.89 
 
 
507 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  43.59 
 
 
540 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 
505 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  43.48 
 
 
518 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  42.83 
 
 
504 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  42.83 
 
 
509 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  43.37 
 
 
532 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  42.71 
 
 
510 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 
505 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  42.74 
 
 
510 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  41.94 
 
 
512 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  42.51 
 
 
514 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  43.28 
 
 
540 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  43.39 
 
 
540 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  44.18 
 
 
516 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  42.94 
 
 
510 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 
505 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  42.02 
 
 
516 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  42.54 
 
 
509 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  42.69 
 
 
542 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  41.42 
 
 
533 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  41.97 
 
 
511 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  42.42 
 
 
504 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  42.48 
 
 
524 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  42.2 
 
 
514 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
532 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  42.23 
 
 
509 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>