234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0222 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  100 
 
 
516 aa  1060    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  73.67 
 
 
516 aa  782    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  69.7 
 
 
513 aa  721    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  58.25 
 
 
507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  58.25 
 
 
507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
516 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 
516 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 
516 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  521  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
512 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
516 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  50.99 
 
 
512 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 
510 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.9 
 
 
505 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 
512 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 
512 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 
513 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 
525 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
515 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
512 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 
517 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 
514 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
513 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
512 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  50.96 
 
 
521 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 
513 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
514 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
509 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  48.16 
 
 
533 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.03 
 
 
514 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50 
 
 
515 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
516 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  49.1 
 
 
509 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 
513 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 
511 aa  471  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
514 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 
514 aa  475  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  48.42 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  47.39 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 
511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.31 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.29 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.89 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  47.39 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  47.04 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 
515 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
518 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 
515 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  46.42 
 
 
542 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  45.66 
 
 
542 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 
521 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 
509 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
514 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.2 
 
 
507 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
540 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
510 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 
516 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  48.51 
 
 
510 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  46.55 
 
 
529 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  47.74 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  46.17 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  47.24 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  50.4 
 
 
504 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
524 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
511 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
509 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 
521 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
515 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  47.92 
 
 
511 aa  458  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  45.97 
 
 
509 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  45.03 
 
 
540 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  45.93 
 
 
515 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>