108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1101 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 
409 aa  828    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.32 
 
 
406 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.07 
 
 
406 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  46.1 
 
 
406 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  46.83 
 
 
406 aa  364  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  46.83 
 
 
406 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  46.39 
 
 
414 aa  345  8e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.45 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  46.15 
 
 
411 aa  333  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.1 
 
 
413 aa  328  8e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  41.93 
 
 
411 aa  316  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.61 
 
 
411 aa  310  2e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  42.69 
 
 
406 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.27 
 
 
411 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.92 
 
 
411 aa  293  4e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.68 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.63 
 
 
419 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.28 
 
 
401 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
401 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  35.54 
 
 
401 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.8 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.21 
 
 
402 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
403 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.06 
 
 
432 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
403 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.42 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 
387 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  35.55 
 
 
383 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  34.25 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  34.09 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.19 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  35.22 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
426 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
408 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
409 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  33.57 
 
 
403 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
393 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
401 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
393 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.66 
 
 
385 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 
404 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
393 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
399 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.92 
 
 
426 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
398 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.83 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.46 
 
 
426 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  33.01 
 
 
402 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.85 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
397 aa  196  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
399 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 
399 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
399 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  33.5 
 
 
402 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  33.41 
 
 
405 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  33.24 
 
 
407 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 
428 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.98 
 
 
433 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  31.36 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 
398 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 
396 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
428 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  27.58 
 
 
429 aa  143  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 
428 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  27.79 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 
392 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
421 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  32.47 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  31.25 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  30.21 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  37.84 
 
 
284 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  32 
 
 
512 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0228  metalloenzyme domain protein  34.09 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000085285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  29.73 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1340  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 
518 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.157203  hitchhiker  0.0000000230825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  31 
 
 
512 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2087  metalloenzyme  36.36 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  29.73 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  28.38 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  26.52 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>