127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2331 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 399 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  98.5 
 
 		 399 aa  808    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  73.23 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  68.67 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  66.17 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  63.98 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  64.41 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  61.75 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  53.37 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  50.88 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.38 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.37 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  51.01 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  52.58 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  51 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  53.02 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  49.13 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  47.38 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  49.88 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  48.99 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  48.02 
 
 		 384 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.14 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  47.14 
 
 		 383 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.39 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.89 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  43.84 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  42.25 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.9 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.25 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.74 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.79 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.83 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.85 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.94 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.54 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.25 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.27 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.75 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.01 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.65 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.53 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.99 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.55 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.13 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.9 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.5 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  27.34 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  27.71 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.03 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.82 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  25.24 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  22.13 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  38.71 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  31.48 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  28.12 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  43.1 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  23.87 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  27.22 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  32.81 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  25.5 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  30.83 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.25 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  30.93 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  25.1 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  25.96 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  33.03 
 
 		 533 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  19.43 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  30.11 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  25.74 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  28.38 
 
 		 541 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  28.38 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  28.38 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  28.38 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>