101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0839 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
387 aa  796    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  57.77 
 
 
384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  56.1 
 
 
383 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  58.18 
 
 
383 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  55.21 
 
 
385 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  51.02 
 
 
392 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.37 
 
 
398 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
401 aa  364  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.38 
 
 
399 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48 
 
 
397 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.79 
 
 
399 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.35 
 
 
399 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.83 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 
401 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  42.96 
 
 
404 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  44.76 
 
 
402 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 
398 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  49.31 
 
 
407 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 
397 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  46.01 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  41.4 
 
 
403 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  43.46 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  45.34 
 
 
402 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  40.5 
 
 
402 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.42 
 
 
393 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
393 aa  279  7e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.32 
 
 
393 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.92 
 
 
396 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.4 
 
 
398 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.52 
 
 
414 aa  239  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
411 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 
406 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.25 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.18 
 
 
409 aa  220  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.73 
 
 
411 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
411 aa  212  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
411 aa  208  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
406 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
406 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.22 
 
 
429 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.78 
 
 
426 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.41 
 
 
419 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
403 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.75 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.27 
 
 
401 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
428 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.96 
 
 
421 aa  156  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.03 
 
 
409 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
403 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 
409 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
401 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
408 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  31.08 
 
 
401 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 
395 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
409 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.29 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.29 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.13 
 
 
433 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.21 
 
 
426 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.95 
 
 
426 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.44 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.27 
 
 
426 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 
428 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.76 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  31.65 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  31.76 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  24.62 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  25.1 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  32.43 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  33.9 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  24.12 
 
 
306 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  33.72 
 
 
514 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  32.1 
 
 
490 aa  46.6  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  32.61 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  32.61 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  22.67 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  29.25 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  32.05 
 
 
511 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  32.05 
 
 
511 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  31.58 
 
 
504 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  29.89 
 
 
513 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  31.71 
 
 
515 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  32.93 
 
 
510 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  31.71 
 
 
515 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>