73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00084 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  65.9 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  65.9 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  64.78 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  32.51 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  32.39 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  32.36 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  34.87 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  26.44 
 
 		 341 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  32.12 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  32.12 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  32.12 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  29.51 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  30.09 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  32.1 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  30.43 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  24.5 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  30.51 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  36.54 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  30.56 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  30.56 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  30.47 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  30.47 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  33.93 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  32.61 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  31.41 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  33.72 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  27.17 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  32.47 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  31.53 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  31.46 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  32.34 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  34.4 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  31.08 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  30.82 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  40 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 401 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  31.53 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  29.22 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  31.86 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  27.31 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 399 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  31.91 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 399 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  29.56 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  28.57 
 
 		 383 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  27.44 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  32.56 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  31 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  25.9 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 393 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>