77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2232 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 408 aa  828    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  62.29 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  63.26 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.47 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 401 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  48.28 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.79 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.51 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.55 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.52 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.36 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  47.26 
 
 		 402 aa  348  9e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.69 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.77 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.46 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.42 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.48 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.95 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.79 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.74 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.91 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  29.3 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  31.07 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.42 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  30.35 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  30.19 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  27.48 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  28.91 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  29.49 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.82 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  28.39 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  27.14 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.53 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.54 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.16 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.61 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.8 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  26.07 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  27.48 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.26 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.78 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.34 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  27.76 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  23.24 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  21.95 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  23.06 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  20.86 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>