97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0702 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  100 
 
 		 384 aa  769    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  65.8 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  63.61 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  63.19 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  57.77 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  54.73 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.86 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.51 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.63 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.96 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.61 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 398 aa  361  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.28 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.02 
 
 		 399 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  50.91 
 
 		 405 aa  348  8e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  49.09 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  46.6 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  45 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  48.16 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  45.1 
 
 		 404 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  47.28 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  44.56 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.12 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  44.14 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 393 aa  308  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.08 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.1 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.53 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.41 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.09 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.78 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.02 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 411 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.42 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.59 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.6 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.2 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.79 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.82 
 
 		 409 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  31.04 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.08 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 		 426 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.62 
 
 		 432 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.87 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.77 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.73 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.4 
 
 		 426 aa  122  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.81 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  21.05 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  38.05 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  30.63 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  23.76 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 		 512 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 		 512 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  32.14 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  29.35 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  27.71 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  32.14 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  31.91 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  31.76 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  32.61 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  31.58 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  28.47 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  35.59 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  26.89 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  30.59 
 
 		 511 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  30.59 
 
 		 511 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>