91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1567 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 
429 aa  851    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 
406 aa  342  7e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.45 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.69 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.17 
 
 
406 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.21 
 
 
406 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.39 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.2 
 
 
411 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.18 
 
 
406 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  41.05 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.79 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.3 
 
 
411 aa  303  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.13 
 
 
411 aa  298  1e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  43.44 
 
 
406 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 
411 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.76 
 
 
419 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.41 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
401 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 
401 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.1 
 
 
432 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.12 
 
 
409 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.24 
 
 
426 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  35.78 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.34 
 
 
409 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
409 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  35.77 
 
 
401 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  34.15 
 
 
383 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.95 
 
 
421 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  35.12 
 
 
392 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.88 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
387 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.05 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.79 
 
 
408 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  33.25 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.3 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 
399 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
399 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 
402 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 
401 aa  192  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  28.81 
 
 
403 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
397 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  34.55 
 
 
402 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
401 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.53 
 
 
426 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
426 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  34.08 
 
 
405 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
398 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
399 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.33 
 
 
426 aa  186  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.45 
 
 
385 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.17 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
399 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
399 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
404 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
397 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
398 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  32.78 
 
 
407 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 
393 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.78 
 
 
402 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.48 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  27.47 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
393 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.92 
 
 
396 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 
429 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  26.33 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  26.68 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 
428 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 
378 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
421 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  45.92 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  32.71 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  35.07 
 
 
388 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  26.51 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  35.07 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  31.34 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  33.58 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  29.47 
 
 
532 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  29.47 
 
 
532 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  27.81 
 
 
394 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  25.66 
 
 
506 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1180  metalloenzyme domain protein  30.68 
 
 
312 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.834019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  32.48 
 
 
507 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.78 
 
 
312 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  32.48 
 
 
507 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>