96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1540 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  82.73 
 
 		 411 aa  723    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  83.94 
 
 		 411 aa  710    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 411 aa  824    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  82.97 
 
 		 411 aa  709    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  45.17 
 
 		 414 aa  345  6e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.2 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.34 
 
 		 413 aa  319  5e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 406 aa  318  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.19 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.79 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.27 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.19 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  40.63 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.16 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.42 
 
 		 409 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.38 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  36.74 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  39.55 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.07 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.11 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.41 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.83 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.83 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.65 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  32.67 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.66 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.58 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  33.5 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  32.25 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.54 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  31.47 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  31.47 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.23 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  32.89 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.83 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.29 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  32 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  30.95 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.54 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  29.03 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.29 
 
 		 433 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  28.75 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  40.98 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 514 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 514 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  26.26 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  26.26 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  26.26 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  26.26 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1477  metalloenzyme domain protein  28.45 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  28.43 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  27.64 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  26.26 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1381  metalloenzyme domain protein  28.45 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  34.34 
 
 		 521 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  27.64 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  25.25 
 
 		 513 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2477  metalloenzyme  29.55 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  24.77 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>