127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0776 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 398 aa  820    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  69.42 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  66.17 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  65.16 
 
 		 399 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  63.8 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  63.98 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  63.48 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  60.15 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  51.49 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  50.5 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 401 aa  401  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  52.64 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 		 404 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  52.36 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  51.01 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  50.13 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  50.98 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  50.5 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  49.11 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  45.61 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  48.83 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  46.23 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.22 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.75 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.9 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  40.99 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.96 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 406 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.74 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.74 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.41 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.63 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.62 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  31.04 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.19 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.26 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.54 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.24 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.75 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.53 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.26 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.19 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.61 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  29.3 
 
 		 401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.52 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.79 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  27.76 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.36 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 428 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  22.77 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  23.16 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  20.67 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  30.73 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.86 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  49.15 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  45.16 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  40 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  30.22 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  45 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  44.78 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  45.61 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  29.08 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  28.81 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  26.55 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  30.4 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  37.1 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  25.66 
 
 		 306 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  36.84 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  38.57 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  37.14 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>